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분자유전학

전기영동 (Electrophoresis) 세부 내용 (DNA, RNA, SDS-PAGE, 단백질, EtBr) * Agarose gel 농도와 DNA 크기 Agarose gel 농도에 따라 분리할 수 있는 DNA 크기가 다릅니다. 분리할 수 있는 DNA 크기 단위: 200 bp ~ 50 kb agarose gel 농도가 높을수록(0.3%~2.0% 분리할 수 있는 DNA 크기가 작습니다(50kb~0.1kb). * Ethidium bromide (EtBr) DNA 검출에 사용하는 염료입니다. ds DNA 사이에 정량적으로 들어가 자외선에 의해 주황색 형광을 보입니다. 그래서 전기영동 과정 마지막에 UV조사가 있는 것입니다. EtBr은 발암물질이므로 반드시 장갑을 사용해야 합니다. EtBr에 사용했던 tip은 따로 수거하여 폐기해야 합니다. 요즘은 EtBr 대신 GelRed, GelGreen을 사용하는 추세입니다. 이.. 더보기
암유전자, 종양억제유전자 (oncogene, tumor suppressor gene) (APC, BCL2, BRCA1, BRCA2, ERBB2 (HER2), MYC, RAS, RB1, TP53) (맨 아래에 표 원본이 있습니다.) 암의 발생은 분자유전학적으로는 주로 다음과 같은 기전으로 이루어집니다. 1) 세포의 성장을 촉진하는 암유전자가 비정상적으로 증폭된 경우 2) 암유전자에 유전자 돌연변이가 발생한 경우 3) 암유전자가 활성화된 경우 4) 암억제유전자가 소실되거나 비활성화된 경우 암유전자 (oncogene, 종양유전자) 및 종양억제유전자 (tumor suppressor gene)가 많이 밝혀져 있습니다. 몇 가지 대표적인 암유전자, 종양억제유전자를 설명할 것입니다. 1. APC (adenomatous polyposis coli, 선종성 용종증) APC 유전자는 5번 염색체 장완 (5q22.2)에 위치해 있습니다. APC 유전자는 종양억제유전자 중 하나로, 주로 세포분열에 관여하며, 세포가 .. 더보기
STR 검사, 분석 (short tandem repeat, 짧은연쇄반복, 개인 식별, 법의학, chimerism) Short tandem repeat (STR. 짧은연쇄반복)는 2~7개의 반복되는 염기서열 (nucleotide sequence)입니다.STR은 개인마다 종류가 다양하며, 유전체에 수 만개가 분포되어 있습니다.특정한 STR 표지자를 증폭할 수 있는 primer (시발체)를 이용하여 PCR을 시행하면, 반복단위의 개수 차이를 이용하여 특정한 개인이 가진 유전자를 판정할 수 있습니다.STR이 분포해 있는 대립유전자의 종류가 다양하여 유전표지자로서 정보력이 높습니다.또한 멘델 유전 양식에 의해 유전되므로 가계 분석에도 유용합니다.STR은 염기서열분석 (sequencing)처럼 자동화된 장비로 검사할 수 있어서 개인 식별 검사 중 가장 널리 사용되고 있습니다.법의학적으로 개인 식별에 이용되는 검사인데, 조혈모세.. 더보기
핵산의 순도 수율 평가 (추출) (nucleic acid DNA RNA extraction purity, yield, 오염) (A260/A280 optical density, OD) 핵산 (nucleic acid)에는 DNA, RNA 등이 있습니다. 핵산의 수율 (yield)를 측정하는 방법은 크게 2가지가 있습니다.핵산은 260 nm의 자외선광을 최대로 흡수한다는 특성을 이용하여, 추출한 DNA, RNA의 수율 (yield)은 분광광도계를 이용하여 정량적으로 측정할 수 있습니다.우무겔 (agarose gel) 전기영동 (electrophoresis) 후 densitometer로 수율을 측정할 수도 있습니다. 자외선 분광광도법을 이용하는 경우, 자외선 흡수 복사량은 DNA 양에 비례합니다.260 nm에서 흡광도 (optical density, OD) 1.0은 50 ng/μL의 double-stranded DNA 양과 일치합니다.따라서 추출된 DNA 농도는 아래와 같이 계산할 수 있습.. 더보기