핵산 (nucleic acid)에는 DNA, RNA 등이 있습니다.
핵산의 수율 (yield)를 측정하는 방법은 크게 2가지가 있습니다.
핵산은 260 nm의 자외선광을 최대로 흡수한다는 특성을 이용하여, 추출한 DNA, RNA의 수율 (yield)은 분광광도계를 이용하여 정량적으로 측정할 수 있습니다.
우무겔 (agarose gel) 전기영동 (electrophoresis) 후 densitometer로 수율을 측정할 수도 있습니다.
자외선 분광광도법을 이용하는 경우, 자외선 흡수 복사량은 DNA 양에 비례합니다.
260 nm에서 흡광도 (optical density, OD) 1.0은 50 ng/μL의 double-stranded DNA 양과 일치합니다.
따라서 추출된 DNA 농도는 아래와 같이 계산할 수 있습니다.
DNA 농도 (ng/μL) = OD × 50 × 희석배수
추출된 핵산의 순도 (purity)는 260 nm와 280 nm의 흡광도비 (A260/A280)으로 평가할 수 있습니다.
A260/A280이 1.8 이상이면 단백질의 오염이 최소화되어있다는 것을 뜻합니다.
대개 A260/A280이 1.6~2.0이면 순수한 핵산임을 뜻합니다.
A280쪽이 높으면 단백질이나 탄수화물에 의해 오염된 것을 시사합니다.
A220~A240쪽이 높으면 organics (유기물)에 의한 오염을 시사합니다.
분리된 genomic DNA의 크기는 우무겔 전기영동 (agarose gel electrophoresis)으로 평가할 수 있습니다.
RNA가 얼마나 깨지지 않았는지를 나타내는 RNA integrity는 18S rRNA 및 28S rRNA peak로 평가할 수 있으며, RNase에 의해 파괴될수록 RNA의 크기의 분포는 더 작은 분절쪽으로 나타납니다.
전기영동법이 추출된 DNA 및 RNA의 수율과 질을 평가하는 데에 더 좋은 정보를 주지만, 분광광도계로 평가할 때보다 더 많은 양의 시료가 필요합니다.
Reference
Laboratory medicine, 5th ed.
