HLA nomenclature (명명법) 2010

* HLA antigen nomenclature

HLA-A, B, C 뒤에 밝혀진 순서대로 숫자를 기입

A, B는 숫자가 겹치지 않도록 함

 - w

이전에 혈청학적/세포학적 방법으로 규명된 새로운 항원은 일단 'w'를 붙여 사용하다가 새로운 항원으로 정식으로 인정되면 'w'를 붙이지 않았었다. 최근에는 혈청학적 방법으로 발견되는 경우는 드물고 염기서열분석을 통해 새롭게 밝혀진 대립유전자에 대해 명명.

현재도 HLA-C는 보체와의 혼동을 피하기 위해 혈청학적 명칭에는 Cw를 사용(대립유전자 명명에서 'w' 삭제)

HLA-Bw4, Bw6: 여러 종류의 HLA-B 항원에서 표현되는 공통항원기를 나타내므로 다른 HLA-B 개별항원과 구별하기 위해 'w'를 붙임.

HLA class II도 마찬가지로 DR, DQ, DP 뒤에 숫자를 붙임

세포학적 방법으로 규명된 HLA-D의 경우 Dw로 표기

혈청학적 명명법은 혈청학적 특이성이 정의된 순서에 따라 명명

 - 처음에 명명된 항원에 이후에 더 세분화되어 명명되는 경우

   세분화된 항원: split 항원(subtypic or private specificity)

   세분화되기 전의 항원: broad 항원(supertypic or public specificity)

   세분화된 항원은 분화 전 항원에 대한 항혈청에도 양성

   Ex) A23, A24는 A9에서 split된 항원. 각각 A9 항혈청에도 양성.

항원 명칭은 대개 1자리(A1, A2) 또는 2자리(A23, A24)

간혹 DNA 검사를 하지 않고도 대립유전자 수준(B*07:03, B*51:02)의 항원을 혈청학적 방법으로 검출할 수 있는 경우 3자리(B703), 4자리(B5102) 항원명도 있음

* HLA allele nomenclature

2004년: 각 영역의 구분 표시 없이 2자리수씩 할당.

HLA allele 종류가 급증하여 위 명명법 이용에 한계.

2010년 4월 새로운 명명법 도입.

 - 주요 변화

   1) 각 영역간에 colon(:)을 사용하여 구분

   2) HLA-A*92군, -B*95군, DPB1 allele 명명의 변화

   3) HLA-C allele 명명에서 'w' 삭제

   4) 'P', 'G' 접미사 도입

Ex) HLA-B*15:01:01:02N

 1) HLA-B genetic locus

 2) Locus와 allele 명칭 사이에 * 표시

 3) 1번째 영역 15: 혈청학적 형별 또는 염기서열 유사성이 높은 allele

 4) 2번째 영역 01: exon 부위에 염기서열 차이가 있고 아미노산 변이도 동반되는 allele

 5) 3번째 영역 01: exon 부위에 염기서열 차이가 있지만 아미노산 서열에는 변화가 없는 동일계 염기치환(synonymous / silent substitution)을 나타내는 allele

 6) 4번째 영역 02: 아미노산을 코딩하지 않는 부위(intron, 5'UTR, 3'UTR)의 염기서열에 차이가 있는 allele

 7) 접미사 N, L, S, Q

    N: null. 단백분자로 전혀 발현되지 않는 allele

    L: low. 정상 allele과 비교하여 세포 표면에서의 발현량이 극히 적은 allele

    S: soluble. 유전자는 발현되지만 세포 표면에 발현되지 않고 세포 밖으로 분비되는 allele

    Q: questionable. 세포 표면에서의 발현에 중대한 영향을 미치는 염기서열 변이를 갖고 있지만, 유전자 발현 양상이 단백분자 수준에서 직접 확인되지 않아 확실한 결론을 내리지 못한 allele

* 임상 적용

HLA allele 명칭에서 1영역과 2영역의 숫자가 하나라도 다른 allele들은 아미노산 서열이 다른 것들.

3~4영역의 숫자가 다르더라도 1~2영역의 숫자가 동일한 allele은 아미노산 서열이 동일.

장기이식 등을 위한 검사에서는 HLA 분자의 항원결합부위를 중심으로 한 아미노산 서열 정보가 중요하므로 1~2영역까지만 표기하는 경우가 많음.

그러나 1~2영역에서 숫자가 동일하더라도 N 접미사가 붙은 allele은 단백분자로 발현되지 않는 것이므로 동일한 아미노산 서열을 나타내는 allele이라고 할 수 없음.

N 접미사를 정확히 구분하고 보고하는 것이 필요.

* Allele 명명은 이탤릭체 대문자 (A*01:01:01:01)

* 단백분자 명명은 이탤릭체 아님 (A*01:01:01:01)

References

진단검사의학 제 5판. p780-2.

Lee KW et al. New HLA nomenclature (2010) and its clinical application in Koreans. Korean J Lab Med. 2010 Jun;30(3):203-17. https://doi.org/10.3343/kjlm.2010.30.3.203

S G E Marsh et al. Nomenclature for factors of the HLA system, 2010. Tissue Antigens. 2010 Apr; 75(4): 291?455. https://dx.doi.org/10.1111%2Fj.1399-0039.2010.01466.x